Целями деятельности Комитета являются:

1) содействие укреплению межнационального и межконфессионального согласия на территории Томской области;

2) содействие развитию институтов гражданского общества на территории Томской области.

Задачами деятельности Комитета являются:

1) координация деятельности исполнительных органов государственной власти Томской области при взаимодействии с органами местного самоуправления муниципальных образований Томской области, территориальными органами федеральных органов исполнительной власти по Томской области по вопросам, относящимся к сфере деятельности Структурного подразделения;
2) содействие в пределах компетенции органам местного самоуправления муниципальных образований Томской области в подготовке и проведении выборов, референдумов в соответствии с избирательным законодательством;
3) участие в реализации на территории Томской области государственной национальной политики в сфере межнациональных и межконфессиональных отношений;
4) обеспечение взаимодействия с общественными организациями, политическими партиями, национальными и религиозными объединениями, другими некоммерческими организациями;
5) осуществление международного и межрегионального сотрудничества по вопросам межнациональных и межконфессиональных отношений.